Når The Punisher har tatt ut en illegal våpenhandler oppdager han et mye større terrorkomplott som etterforskes av S.H.I.E.L.D.-agenten Black Widow. The Punisher blir anholdt av det fredsbevarende byrået, men tilbys frihet i bytte mot å samarbeide med Black Widow for å stoppe terroristgruppen Leviathan.