Jättimäinen ja suunnattoman voimakas vieras olio tunkeutuu Federaation alueelle, tuhoaa kolme Klingonien alusta ja neutralisoi kaiken tiellään olevan. Kun olio suuntaa kohti maata, amiraali James T. Kirk palaa uudistetun Enterprise-aluksen päälliköksi ja suuntaa kurssin kohti hyökkääjää.