Da The Punisher skiller sig af med en illegal våbenhandler opdager han et meget større terrorkomplot som opklares af S.H.I.E.L.D. agenten Black Widow. The Punisher bliver tilbageholdt af den fredsbevarende tjeneste, men får et tilbud om at komme på fri fod, hvis han vil samarbejde med Black Widow om at stoppe terroristgruppen Leviathan.