Molly Mahoney er den noe merkelige og usikre sjefen på Mr. Magoriums Wonder Emporium, den mest fantastiske, annerledes og fantastiske leketøybutikken i verden. I en alder av 243 å bestemmer Mr. Magorium seg for å overlate butikken til Molly, samtidig som en ny regnskapsfører begynner. Han forstår ikke den utrolige butikken og dens magi, så Molly og resten av personalet går sammen og protesterer mot regnskapsføreren ved å stanse all magi i butikken til han forstår hvor flott og bemerkelsesverdig butikken faktisk er.