Agentti, joka paljasti CIA:n operaation ostaa salaisia venäläisiä asiakirjoja, ilmaantuu yllättäen rauhalliseen rannikkokaupunkiin, johon Bourne ja Marie ovat muuttaneet uuden identiteetin turvin pakoon menneisyyttä. Bournen on paettava ja pysyäkseen hengissä jälleen palattava entiseen elämäänsä salamurhaajana.