Edellisestä osasta Sharknado 1 tuttu Fin Shepard ja hänen ex-vaimonsa April Wexler ovat matkalla New Yorkiin markkinoimaan Aprilin kirjoittamaa kirjaa How to Survive a Sharknado and Other Unnatural Disasters. Heidän ollessaan lentokoneessa keskellä myrskyä konetta päin alkaa yllättäen lennellä haita. Lopulta koneen moottori hajoaa ja useita ihmisiä kuolee. April loukkaantuu pahasti, mutta Fin onnistuu saamaan koneen laskeutumaan lentokentälle.