398 päivää nuori tanskalainen freelancevalokuvaaja Daniel Rye istui terroristijärjestö Isisin panttivankina Syyriassa, yhdessä monen muun ulkomaalaisen, mm. amerikkalaistoimittaja James Foleyn kanssa. Elokuvassa seuraamme Danielin taistelua eloonjäämisestä vankeudessa, hänen ystävyyttään Jamesin kanssa ja sitä, kuinka perhe kotona Tanskassa käsittelee sitä pelkoa, ettei heidän poikansa koskaan tule kotiin. Kriisin keskiössä on tanskalainen panttivankineuvottelija Arthur, jolla on ratkaiseva osa Danielin vapautumisessa.