Agentti 47 on geneettisesti muokattu salamurhaaja, jonka ainoa identiteetti on niskaan tatuoitu numerollinen viivakoodi. Usean vuoden tutkimus on tuottanut tuloksena merkittävää voimaa, nopeutta, kestävyyttä ja älykkyyttä. Suuryritys haluaa nyt selvittää miehen salaisuuden kootakseen oman armeijan. Yhdessä nuoren Katian kanssa joutuu 47 kohtaamaan menneisyytensä, mikä johtaa lopulliseen taisteluun hänen pahinta vihollistaan vastaan.