Blackfish kertoo yhdysvaltalaisessa Sea World -huvipuistossa eläneestä miekkavalas Tilikumista, joka oli osallisena kolmeen kuolemantapaukseen. Dokumentissa tarkastellaan lukuisten haastattelujen ja kuvamateriaalin avulla huvipuistoissa elävien miekkavalaiden kohtaloa sekä sitä, mitä voi tapahtua, kun miekkavalaiden kaltaisia älykkäitä ja tunne-elämältään kehittyneitä eläimiä pidetään vankeudessa.