Året er 2065, og krig har gjort Jorden ubeboelig. Menneskehedens tilbageværende overlevende sender en flåde af rumskibe ud i søgen efter et nyt hjem. Efter syv års rejse nærme The Pegasus sig sin destination, da de støder på et skib, der er forlist. Men snart opdager besætningen, at de ikke er alene og må kæmpe for deres overlevelse - og hele menneskehedens overlevelse.