Vi befinder os i år 2050. Lincoln bor i et utopisk samfund. Som alle de andre indbyggere håber Lincoln på at få muligheden for at komme til "The Island". Men Lincoln opdager, at han og alle de andre er kloner, hvis eneste formål er at forsyne originalerne med "reservedele". Da han har forstået, hvad der venter ham, flygter han sammen med en kvinde.