En ensom samurai vandrer hvileløst rundt i skoven, mens han råber navnet på sin elskede. Historien udfoldes langsomt gennem antydninger og flashbacks. Han har tilsyneladende været en form for gangster, men hvordan er han havnet i skoven, og er det i det hele taget et flashback, eller er det måske et flashforward? Sidney Lexy Plauts meditative samurai-epos er inspireret af den japanske krigerfilosof (og legende) Musashi Miyamoto. Dark Samurai fortælles gennem smukke billeder, og Plaut læner sig dermed op ad en lang japansk filmtradition. Dark Samurai er medproduceret af folkene bag Valhalla Rising og Only Gods Forgives.