Der sker mærkelige forbrydelser i Gotham City, og sporet fører til Pingvinen og hans Animilitia, en gruppe sære skurke med dyretema ved navn Silverback, Cheetah, Killer Croc og den monstruøse Man-Bat. Men Green Arrow, The Flash, Nightwing og selv Red Robin slutter sig til Batman og kæmper sammen mod skurkene i dette helt nye animerede eventyr fra DC Comics.